Если вы хотите увидеть, что делает оболочка mongo javascript, просто удалите скобки, и он покажет вам основной код:
> db.repairDatabase
function () {
return this._dbCommand({repairDatabase:1});
}
//This basically...
>return this.getCollection("$cmd").findOne({repairDatabase:1});
См. этот код в драйвере для реализации.