MySQL - это реляционная база данных. Являются ли данные, которые вы читаете на последовательном порту, реляционными? От твоего использования слов я сомневаюсь.
Если вам нужны данные измерений для определенного интервала, лучше всего подойдет «База данных циклических испытаний». Он даже предлагает возможность хранения старых данных с меньшим разрешением, используя меньше места на диске.
Если вы настаиваете на использовании mysql, вы, вероятно, захотите некоторое время собрать данные и сохранить кусок стандартного размера в виде «большого двоичного объекта» вместе с отметкой времени.