Изменили ли вы каталог загрузки медиафайлов после загрузки файлов, но не переместили ни один из файлов? Похоже, ошибка 404, или поврежденная база данных, которая потеряла данные (и имеет только мета-информацию о загрузках)
Еще одна вещь, которую я бы проверил, это то, что apache имеет полный доступ на чтение / запись к соответствующим папкам мультимедиа. Например, в Ubuntu,
chown www-data /home/public_html/website/wp-content/uploads -R