Надеюсь, я вас правильно понял, и вы хотите установить маркер click
только для флажка, а не для ячейки, имеющей флажок.В случае, если вы просто измените строку
$(rows[i].cells[iCol]).click(function (e) {
на
$("input", rows[i].cells[iCol]).click(function (e) {
См. Модифицированную демонстрацию здесь .