Конечно, это так. Посмотрите на ./configure --help.
Существует также целое руководство, посвященное R Установка и администрирование , в котором есть целый раздел, посвященный Установка R под Windows .
Наконец, R поставляется с предустановленной для 32- и 64-битной Windows, так что, может быть, вам даже не нужно собирать из исходного кода?