Я помню, что каждая вкладка в Chrome является отдельным окном, тогда почему окно предупреждения на любой вкладке блокирует другие вкладки?
Все ли вкладки используют один и тот же движок JavaScript?
Chrome исправил это в 2017 году. Теперь, когда вкладка предупреждает, другие вкладки не будут блокироваться.
См .: https://bugs.chromium.org/p/chromium/issues/detail?id=456
Проверьте эти ссылки ...
http://code.google.com/p/chromium/issues/detail?id=89579
http://code.google.com/p/chromium/issues/detail?id=3658
Блок Javascript Alert box