Вы правы: драйверы ядра уже используют эти порты.Я предполагаю, что вы работаете на коробке Intel, поэтому, скорее всего, вы используете драйвер 8250.Вы можете попытаться выгрузить через:
modprobe -vr 8250
, но это, скорее всего, не удастся, если вы используете ядро, предоставленное дистрибутивом, так как большинство из них имеют этот модуль "встроенным".Вы можете проверить это с помощью
grep CONFIG_SERIAL_8250 /boot/config-`uname -r`
, и вы получите CONFIG_SERIAL_8250=y
, тогда вам нужно скомпилировать ядро, где драйвер 8250 фактически является загружаемым модулем.