Мне наконец удалось это сделать после множества неудачных попыток. Вот строка конфигурации, которая будет собирать библиотеку libphp5.a в OSX для PHP 5.3.6:
./configure --enable-embed=static --disable-libxml --disable-dom --disable-simplexml --disable-xml --disable-xmlreader --disable-xmlwriter --without-pear --without-iconv
Затем, при ссылке на код C / C ++, вам нужно добавить libresolv, чтобы предотвратить ошибки ссылок, связанные с функциями DNS в Zend Engine. Например:
g++ -o yourapp src/main.o -Lpath/to/libs -lphp5 -lresolv
Надеюсь, это поможет кому-нибудь однажды: -)