Теоретически, да, но вам не стоит об этом беспокоиться. В частности, в 2D-игре, не требующей большого количества графики, улучшение производительности будет едва заметным (если вообще заметно). Производительность может снизиться, если у вас много оверрейдов; рисуя много прозрачных слоев друг над другом.
Сначала вы должны попробовать: как это работает без рисования только определенных квадратов, и если это действительно становится медленным, вы можете снова подумать об оптимизации.