Имя таблицы schema_migrations хранится в ActiveRecord::Migrator.schema_migrations_table_name
, которую вы могли бы мне переопределить (в environment.rb, инициализаторах и т. Д.), Но я не пробовал это.
С другой стороны, если вы используете уникальные идентификаторы миграции в обоих приложениях (по умолчанию, начиная с версии 2.1, я думаю), миграции из двух приложений должны работать с одной таблицей schema_migrations.
См. эту скринкаст для получения дополнительной информации о том, как работают миграции в Rails 2.1 и выше.