Если ранее он дал вам пустую строку, это (скорее всего) означает, что переменная не была установлена (по умолчанию она не установлена), поэтому вы можете просто сбросить ее:
unset LD_LIBRARY_PATH
Несколько других вариантов для эксперимента:
export MY_PATH=/my/path
export MY_PATH2=/my/path2
export LD_LIBRARY_PATH="${MY_PATH}:${MY_PATH2}"
echo $LD_LIBRARY_PATH
/my/path:/my/path2
Удаление пути с конца:
export LD_LIBRARY_PATH="${LD_LIBRARY_PATH/:${MY_PATH2}/}"
echo $LD_LIBRARY_PATH
/my/path
Аналогично, удаление пути с начала (если установлено как указано выше):
export LD_LIBRARY_PATH="${LD_LIBRARY_PATH/${MY_PATH}:/}"