git submodule init
и git submodule update
должны запускаться при клонировании проекта с субмодулями, чтобы вы могли получить содержимое субмодулей.Это не для запуска репозитория, в который вы добавили проект.
Кроме того, если вы пытались выполнить обновление в клоне, похоже, что вы произвели свою собственную регистрацию в подмодуле RestKit и убежищеt опубликовано (конечно, в этом случае, я полагаю, у вас не будет доступа к нему), и инициализация субмодуля завершится неудачей, поскольку сделанный вами коммит не доступен клону.
Читать здесьдля деталей механики субмодуля: http://progit.org/book/ch6-6.html