Вам нужна одна из способностей, которую дает вам настройка CSS, помимо того, что вы можете сделать напрямую? Для изменения цвета вы можете сделать это непосредственно с палитрой виджета, которая должна сохранить ваш стиль.
Кроме того, помните, что изменения стиля наследуются, поэтому, если любой виджет, содержащий дерево справа, имеет стиль, отличный от любого, содержащего дерево слева, это также может вызвать изменения.
Кроме того, я думаю, что это ошибка Qt, если единственное отличие - это таблица стилей css.