это плохо ...
но для этого, если js не удаленный, используйте AJAX для чтения содержимого файла, затем измените то, что вам нужно, затем используйте DOM для создания тега сценария и используйте .innerHTML для помещения содержимого.
если вы хотите код, скажите мне, если вы хотите JQuery или нативный, и я опубликую
P.S. Если файл удаленный, сделать это невозможно ...