В случае, если кто-то еще придет сюда, кнопки - это ToolButtons на панели инструментов с классом "inline-toolbar"
self.listTools=Gtk.Toolbar()
self.listTools.set_property("icon_size",1)
context=self.listTools.get_style_context()
context.add_class("inline-toolbar")
self.addButton=Gtk.ToolButton()
self.addButton.set_property("visible",True)
self.addButton.set_property("can_focus",False)
self.addButton.set_property("use_action_appearance",False)
self.addButton.set_property("use_underline",False)
self.addButton.set_property("icon_name","list-add-symbolic")
self.listTools.add(self.addButton)
Я не уверен, необходимы ли все специфические свойства кнопки
Я упаковал дерево над панелью инструментов и окно ScrolledWindow и присвоил ему эти свойства
scrolled_window = Gtk.ScrolledWindow()
scrolled_window.add_with_viewport(self.objectsView)
scrolled_window.set_property("shadow_type","in")
Затем, наконец, я упаковал окно ScrolledWindow над панелью инструментов в VBox