В настоящее время нет способа сделать это в clojure.contrib.sql, потому что ни один хук не может работать с PreparedStatement до выполнения запроса.
Я открыл проблему JIRA для clojure.java.jdbc - новой замены для clojure.contrib.sql - чтобы раскрыть способ разрешить это:
http://dev.clojure.org/jira/browse/JDBC-6
Ваша единственная возможность сейчас - это работать напрямую с низкоуровневыми частями библиотеки, чтобы самостоятельно получить PreparedStatement и вызвать (.setFetchSize stmt 1000), а затем обработать параметры и выполнить запрос. Некрасиво. Я исправлю это:)