Как уже было предложено, я бы посоветовал вам использовать Maven для создания архетипов, но также потому, что Maven предложит вам абстракцию от вашей IDE (то есть, если вам не нравится то, что Eclipse должен делатьпредложение, просто бросьте его для любой другой современной IDE, и ваш проект должен быть готов для использования (надеюсь) в этой более новой IDE.