Во-первых, вы не хотите указывать на файл php. CI имеет только index.php. Если вы в отчаянии, вы можете указать все search.php на index.php ...
Я бы подошел к этому на этой основе ...
Отправьте форму в контроллер, используйте проверку формы для обеспечения безопасности ввода, возьмите переменную и используйте функцию перенаправления, подобную этой
redirect('/search/'.$this->input->post('q') );