Сомнительно, что WebSphere делает что-то особенное для файлов Spring XML; Он не «знает» о весне, AFAIK.
Также сомнительно, что Spring делает что-то особенное для кеширования своих XML-файлов; не будет никакого преимущества в производительности в файлах кэширования Spring, которые обычно читаются / используются один раз при запуске веб-приложения, а не снова.
Если вы действительно получаете устаревшие XML-файлы, я ожидаю, что проблема связана с тем, как ваши обновления развертываются в веб-приложении. Возможно, файлы не копируются или не распаковываются, или веб-приложение перезапускается неправильно.