Вам не нужно иметь этот сертификат в цепи на устройстве. Вам необходимо загрузить его и добавить в заголовки запроса, который вы делаете.
В C # я делаю это, сохраняя сертификат как встроенный ресурс, загружая байты в класс X509Certificate2 и используя его в запросе к API.
Вопрос: зачем он нужен на устройстве?
обновление :
Вы добавили сертификат в сертификаты management ? : o) Просто уточнить, что вы можете добавить сертификаты двумя способами, один из них находится в сертификатах управления в разделе Hosted Services, Storage Accounts & CDN . Убедитесь, что вы добавили его под правильным идентификатором подписки, и что вы вызываете HTTP с правильными параметрами (чаще всего проблема в моем случае).