Если вы уже зафиксировали файлы .project и / или .classpath, не все потеряно!
Удалите файлы .project и / или .classpath вручную: вы можете использовать командную строку,например, или перейдите к своему проекту в окне навигатора (не в Eclipse), где вам нужно будет показать скрытые файлы.
Обновите ваш проект в Eclipse, и он выдаст вам множество ошибок.
Подтвердите (щелкнув правой кнопкой мыши по проекту) тот факт, что файлы были удалены.
Затем вы можете перестроить свой проект, чтобы избавиться от ошибок.