Этот вопрос возникает время от времени. Каждый раз, когда я сталкиваюсь с подобным вопросом, оказывается, что приложение, отображающее данные, подключается к другой базе данных, чем та, которую вы обновляете через phpMyAdmin.
Поэтому я рекомендую не принимать ничего и дважды проверять каждое соединение с базой данных как в ваших приложениях, так и в сеансах phpMyAdmin.