Если я правильно понимаю вопрос, думаю, у вас есть два варианта.
Один. создать классы для определенного направленного текста и стиля соответственно. Итак
<td class="rtl"></td>
и КСС
td.rtl{
direction:rtl;
padding-left:20px; //OR WHATEVER
}
А потом наоборот для ltr
Два. установить отступ в одну сторону. Затем с помощью jQuery определите направление и настройте его соответствующим образом.
Так что-то вроде
$('td').each(function(){
if($(this).css('direction') == 'rtl'){
$(this).css({'padding-left':'//whatver','padding-right':'0'});
}
});