Хорошо, первая интуиция здесь:
handlers = java.util.logging.FileHandler, java.util.logging.ConsoleHandler
.level = ALL
Анализатор Java-файлов не так уж и умен, я не уверен, что он справится с этим. Но я пойду посмотрю документы снова ...
А пока попробуйте:
handlers = java.util.logging.FileHandler
java.util.logging.ConsoleHandler.level = ALL
Обновление
Нет, нужно больше кофе. Nevermind.
Хотя я и думаю больше, обратите внимание, что вы можете использовать методы из Свойства для загрузки и печати файла проп: возможно, стоит написать минимальную программу, чтобы увидеть, что, по мнению Java, она читает в этом файле .
Еще одно обновление
Эта строка:
FileInputStream configFile = new FileInputStream("/path/to/app.properties"));
имеет дополнительный конец. Это не скомпилируется. Убедитесь, что вы работаете с файлом класса, которым вы себя считаете.