Они не будут затронуты в процессе обновления. Однако я хотел бы отметить, что папка Caches предназначена для данных, которые только что кэшируются, а не для данных, которые, как вы ожидаете, будут всегда доступны. ОС оставляет за собой право избавиться от чего-либо в папке caches. Если вы задаете этот вопрос, то я предполагаю, что вы хотите, чтобы данные были постоянными, поэтому вы должны знать, что начиная с iOS 5, Apple специально заявляет , что данные в каталоге caches могут быть удалены в любое время (кроме пока ваше приложение работает).