Если ваш идентификатор на самом деле является ObjectId mongo (то есть «4e2675b04aa5520000000002» на самом деле равен единице), то гораздо эффективнее сохранить его как таковой, а не строку, как с точки зрения размера, так и производительности.
Обратите внимание, что на самом деле также определено условное обозначение, подробности здесь: http://www.mongodb.org/display/DOCS/Database+References#DatabaseReferences-DBRef
Большинство драйверов позволяют автоматически получать упомянутые документы без необходимости запрашивать их вручную. Так как это поведение может помешать, я думаю, что обычно предпочитается просто сохранить ObjectId ("4e2675b04aa5520000000002") в качестве значения, как вы предлагаете.