Да, теоретически это возможно благодаря интересному способу работы FTP. На практике, скорее всего, потребуется посредственный FTP-клиент, работающий с двумя серверами.
Сценарий межсерверной передачи описан и схематически проиллюстрирован в разделе 5.2 FTP RFC (959). Одним словом, одному серверу отправляется команда PASV, которая возвращает IP-адрес и номер порта для посредника. Посредник отправляет это на другой сервер в команде PORT, и этот сервер устанавливает соединение для передачи данных непосредственно с первым сервером.