Я хочу напечатать текущий файл обработки, используя переменную QMAKE_FILE_IN, как это сделать.
Попробуйте формат сообщения ниже
message($$QMAKE_FILE_IN)
Вы можете добавить другой текст с переменной, как следует
message(qmake file in value = $$QMAKE_FILE_IN)
"Сообщения записываются для каждого файла Makefile, сгенерированного qmake для данного проекта." (из документации), а не во время изготовления.