Потратив немного больше времени на это, я согласен с @grapefrukt. Установка прозрачного wmode приводит к разным странным проблемам, и, на мой взгляд, этого следует избегать.
Вместо этого я прибегнул к передаче цвета фона в качестве параметра. Я использую следующий ActionScript для рисования фона.
var parameters:Object = LoaderInfo(this.root.loaderInfo).parameters;
opaqueBackground = parameters["background-color"];
РЕДАКТИРОВАТЬ: Спасибо @grapefrukt за напоминание мне о параметре bgcolor (что делает ActionScript выше совершенно ненужным)