SQLYog имеет опцию Designer Schema Ctrl + Alt + D , которая открывает окно Designer Schema.
Щелкните правой кнопкой мыши внутри Schema Designerхолст, чтобы получить маленькое окно, установите флажок добавить таблицы (установите все флажки, если хотите, чтобы все они были на холсте)
Нажмите Добавить , чтобы получить диаграмму ER таблиц.