Используя гиперграфы в pygraph, нужно проверить, что пример правильный - PullRequest
0 голосов
/ 11 марта 2012

Я пытаюсь разобраться, используя гиперграфы в pygraph, вот простой пример, который я вставил:

hgr = hypergraph()
hgr.add_nodes(["A1", "B1", "C1", "D1"]) 
hgr.add_nodes(["A2", "B2", "C2", "D2"])
hgr.add_nodes(["A3", "B3", "C3", "D3"])
hgr.add_nodes(["A4", "B4", "C4", "D4"])

hgr.add_hyperedge(("A1", "A2", "A3", "A4"))
hgr.add_hyperedge(("B1", "B2", "B3", "B4"))
hgr.add_hyperedge(("C1", "C2", "C3", "C4"))
hgr.add_hyperedge(("D1", "D2", "D3", "D4"))

h_dot = write(hgr)
h_gvv = gv.readstring(h_dot)
gv.layout(h_gvv,'dot')
gv.render(h_gvv, 'png', 'hypergraph.png')

Изображение, которое я получаю (нажмите, чтобы увидеть полноразмерную версию): output of above hypergraph construction

Убедитесь, что это правильный способ создания гиперграфа с использованием pygraph.

Очень ценится!

1 Ответ

2 голосов
/ 05 мая 2012

Поскольку каждый гиперредж не является набором узлов, а вместо этого представлен в виде узла, вы должны использовать уникальный (простой) идентификатор для гипергиг , так же, как вы делаете для узлов, а затем ссылка их на узлы.

Рассмотрим пример графика в статье Википедии для гиперграфов :

Wikipedia hypergraph

Чтобы создать этот график в pygraph, вы можете сделать следующее:

from pygraph.classes.hypergraph import hypergraph
from pygraph.readwrite.dot import write_hypergraph

h = hypergraph()

h.add_nodes(['v1', 'v2', 'v3', 'v4', 'v5', 'v6', 'v7'])
h.add_hyperedges(['e1', 'e2', 'e3', 'e4'])

h.link('v1', 'e1')
h.link('v2', 'e1')
h.link('v3', 'e1')
h.link('v2', 'e2')
h.link('v3', 'e2')
h.link('v3', 'e3')
h.link('v5', 'e3')
h.link('v6', 'e3')
h.link('v4', 'e4')

with open('hypergraph.dot', 'w') as f:
    f.write(write_hypergraph(h))

, который будет выводить это изображение с dot:

Dot hypergraph

Это правильное представление, я думаю, но не такое визуальное, как изображение из Википедии. Если вы стремитесь к визуализации гиперграфов, вам следует проверить этот вопрос .

...