Большинство программ для скрытия папок работает с помощью расширения для Windows Explorer или драйвера фильтра файловой системы.
Первый метод означает, что некоторые элементы не будут видны при просмотре папок в Windows через пользовательский интерфейс, но все равно будут видны для другого программного обеспечения и через командную строку. Например, папки «Корзина» и «Временные файлы Интернета» работают следующим образом.
Метод драйвера фильтра файловой системы передает вызовы между Windows и основной файловой системой и пропускает только определенные запросы. Это похоже на то, как антивирусные сканеры предотвращают доступ к зараженным файлам.