Примерно так должно работать:
$authAdapter = new Zend_Auth_Adapter_DbTable(
$dbAdapter,
'usertable',
new Zend_Db_Expr('LOWER(username)'),
'password'
);
$authAdapter
->setIdentity(strtolower($this->_getParam('username'))
->setCredential($this->_getParam('password'));
И обязательно используйте один из параметров сортировки * _ ci в вашей базе данных для поля имени пользователя (ci = без учета регистра).Надеюсь, это поможет