Если вы хотите сохранить трассировку стека в строку, вы можете сделать это;
String exception = "";
for (StackTraceElement element : e.getStackTrace())
exception += element.toString() + "\n";
Где e, очевидно, исключение.
Кроме того, звучит очень странно, чтобы автоматически генерировать собственное исключение, просто чтобы найти трассировку стека для отладки. Получить Eclipse и использовать его режим отладки, это действительно круто.