У меня была похожая проблема, и я наткнулся на сообщение, чтобы решить проблему. Моя html-форма (testform.html) вызывала скрипт php (runQuery.php), и Netbeans не мог сломаться в установленных точках разрыва в моем runQuery.php
После проверки всех параметров конфигурации в php.ini и Netbeans путем поиска на форумах, подобных этому, я обнаружил, что netbeans будет ломаться только на точках останова, если файл индекса для проекта является файлом PHP. Это очень важно, иначе вы потратите часы, пытаясь выяснить, почему не работают точки останова.
В Netbeans зайдите в Файл / Свойства проекта / Запустить конфигурацию и убедитесь, что файл индекса является файлом PHP. В моем случае я изменил свой индексный файл с testform.html на testform.php, и это сработало, я смог разбить точки останова.
Яшар