Если у вас относительно много файлов, вы можете попробовать проект на основе Eclipse:
http://code.google.com/p/chromedevtools/
Если вам удастся настроить поиск по источнику, у вас будет отладчик, перешагивающий ваши рабочие файлы и живое редактирование.
Вместе с установленными JSDT или Aptana это может быть весьма полезным.
Однако вы получите только JS-отладчик, дерево DOM не поддерживается.