Обычное место для кода запуска - в файле urls.py (когда вам нужно, чтобы настройки были уже загружены). У Джанго пока нет подходящего места для этого.
(Существует ветвь «app refactor», над которой студент-gsoc работал в 2011 году, но она еще не была объединена с core django. Этот «refactor app» включает решение самой проблемы, но это Тебе помочь ...)
Вы упоминаете, что команда управления также нуждается в этом. Это ваша собственная команда управления? Ничто не мешает вам импортировать urls.py, не так ли?
Это является, к сожалению, одним из немногих слабых мест Джанго. К счастью, их не так много: -)