Из macports Список ошибок
"список портов установлен" не делает то, что вы думаете, что он делает.«список портов установлен» возвращает список имен всех установленных портов, и для каждого из них отображается текущая версия, независимо от того, какая версия установлена.
Для просмотра установленных версий вы хотитеиспользовать «порт установлен».
Неактивные версии - это старые порты, которые были заменены более новыми, которые активны.
port list inactive
показывает порты, которые не используются.больше и в вашем случае должен отображаться один из каждого дубликата (или 2 или триплеты и т. д.)
port uninstall inactive
удалит неактивные порты и оставит вам только один.