Вы можете создать простой (обычный) проект django и использовать inspectdb
для создания начальных моделей из вашей базы данных sqlite, затем используйте dumpdata
для сохранения его в файлы,Позже вы можете использовать loaddata
в своем новом проекте для загрузки его в свои модели.
Если вам нужна дополнительная обработка, вы можете создать небольшой скрипт, который копирует данные из старых моделей вновые модели.