Если ваш модуль представляет собой jar-файл, который должен быть включен в качестве зависимости другим модулем, у вас не должно быть logback.xml - пользователь jar-а должен решить, какую конфигурацию журналировать.Не следует также указывать logback как зависимость, поскольку пользователь должен выбрать реализацию ведения журнала.
Я предполагаю, что один из ваших двух модулей зависит от другого.Таким образом, зависимый модуль должен иметь logback.xml, а другой - нет.
При модульном тестировании каждого модуля вы можете поместить logback-test.xml в src/test/resources и добавить logback в качестве тестовой области.зависимость.Таким образом, он не будет указан как зависимость модуля, а xml-файл logback не будет экспортирован.