Вы только что задали все возможные вопросы по обработке трехмерных изображений.Вы не получите аккуратный ответ.Пожалуйста, разделите, а затем победить.Ниже приведено несколько ключевых слов для отслеживания!
Можно ли сравнить два 3D-изображения?-> метрики сходства изображений, такие как средние квадраты, нормализованная корреляция, интенсивность структуры, взаимная информация -> вы можете делать это только в том случае, если ваши изображения зарегистрированы .Проверьте жесткую регистрацию или нежесткую регистрацию.
Определите объект в этом исходном изображении.-> это тема сегментации (в 3D) или компьютерного зрения (в 2D)
Как я могу обнаружить объект на изображении (ROI)?Как сформировать границы объекта при обнаружении?-> это тема обнаружения краев, см. Canny Edge, например.
Как удалить другие данные на изображении, кроме как оставить объект?-> тривиально, вы просто вычитаете, как только это у вас есть.
Множество ресурсов в медицинской визуализации.Посмотрите, что может сделать ITK.Некоторые программы с открытым исходным кодом включают 3DSlicer, 3DSeg, ...