Почему вы теряете какие-либо возможности, если используете шаблоны с jQuery? Вы можете создавать экземпляры элементов с помощью шаблонов и связывать их как обычно - во время шаблона или с помощью предустановленных обработчиков .live()
.
Хотя я бы посмотрел, чтобы убедиться, что Backbone.Router
не дает вам более элегантный способ управления вашими взаимодействиями.