Я использую NetBeans 8.0.2 в Windows 7.
Проекты в моей рабочей области также находятся в «Project Group» корневым каталогом для набора проектов. (То, что Eclipse назвал бы «рабочим пространством» для всех проектов или «Рабочим набором» для подмножества проектов.)
В C:\Users\<myname>\AppData\Roaming\NetBeans\8.0.2\config\Preferences\org\netbeans\modules\projectui\groups\<mygroup>.properties
указан путь к группе проектов.
В Проводнике переместите (: или скопируйте, если вы достаточно параноик :) ваши каталоги рабочего пространства на новый диск.
Отредактируйте этот файл и измените расположение диска для группы.
NetBeans теперь будет видеть новое местоположение при его открытии и загружать рабочее пространство и группы.
Используйте File / Project Groups ...
, чтобы убедиться, что вы смотрите на группу, на которую, по вашему мнению, смотрите.