В зависимости от данных, вы можете просто выложить их, пока iCloud не запустится в iOS 5, если это пользовательские (и не общие / личные) данные.
В противном случае, просто следуйте тому, что вызнать.Архитектура на стороне сервера и структура транспортных данных могут быть практически такими, какими вы хотите.На каком бы языке вы ни работали (PHP, сервлеты, даже .NET), начните с него.