см. Эту тему: Присоединиться к двум файлам WAV из Java?
Если вы создали wav, который занимает всего несколько секунд тишины, вы можете объединить свои файлы вместе, чтобы получить требуемый результат, silence.wav + myfile.wav + silence.wav
Поток, на который я ссылаюсь, дает вам простой код для объединения wav-файлов. - обязательно проголосуйте за ответ в другой ветке:)
Надеюсь, это поможет,
Имон