Я не думаю, что у opencv есть такая функция.
Самый простой способ сделать это - создать новое изображение IPL_DEPTH_32F, точно такого же размера, как ваше изображение IPL_DEPTH_32S Затем зациклите все пиксели на обоих изображениях и для каждой копии пикселя и приведите целочисленный пиксель к плавающему пикселю.