Я считаю, что эта проблема связана с вашим путем при инициализации PDFkit .
Например:
html_file = File.new('html/your-file.html')
kit = PDFKit.new(html_file, :page_size => 'Letter', :header_html => "**html/template/header.html**", :footer_html => "**html/template/footer.html**")
Это относительный путь, и локальная инициализация в порядке. Возможно, вам следует изменить свой путь для правильной работы с nginx.