I думаю, MSTest.exe можно запустить как самостоятельный процесс. Хотя это и не идеально, вы можете попробовать скопировать исполняемый файл из вашей установки VS на ваш сервер сборки (его можно найти в [Install Base] \ Microsoft Visual Studio 9.0 \ Common7 \ IDE)
Я не пробовал этого, так что имейте это в виду. Может потребоваться некоторое количество проб и ошибок для переноса любых зависимостей, которые могут понадобиться приложению, но я не вижу причин, по которым вы не можете заставить его работать (в конце концов).