Вам нужно немного больше понять, как работают настройки XCode.
По сути, это иерархия, и на каждом уровне вы можете либо иметь определенное значение, в этом случае оно переопределяет родительский параметр, либо нет, в этом случае используется родительский параметр.
Что, вероятно, произошло в вашем случае, так это то, что даже если вы определили это на уровне проекта, есть настройка целевого уровня, которая говорит, что не следует использовать сборку мусора.
Если настройка определена для определенного уровня, она будет выделена жирным шрифтом. Чтобы отменить настройку на определенном уровне, в левом нижнем углу информационного окна есть кнопка, которую вы можете использовать.