Ответы выше слишком старые (последний год назад).У меня была такая же проблема с моим WEKA (версия 3.8.1) в Windows 10.
У меня была проблема с обновлением размера кучи, способ, которым я это исправил, путем добавления переменной среды(под панелью управления) следующим образом:
JAVA_OPTS = -Xms30000m -Xmx30000m
Совет : просто убедитесь, что RunWeka.ini использует эту переменную среды.
В приведенном выше примере я даю WEKA30GB.Оно работает.
Надеюсь, это будет полезно для некоторых людей.